這年，劉學詢以二品頂戴率團訪日，名義上是經貿考察，實際上懷有特殊使命。他受到日本的高規格接待，不僅拜謁了明治天皇，還與前總理伊藤博文、現總理山縣有朋、外務大臣青木周藏、司法大臣青浦奎吾、內務大臣西鄉從道、陸軍大臣桂太郎等進行了深入交談。他與伊藤博文有兩次會談，第一次時間長達4小時15分鐘；與外相青木周藏也有兩次會談，第二次長達7小時。這些，都是其他任何商人，無論是胡雪岩、盛宣懷還是張謇等，難以企及的。

　　劉學詢在日本期間，曾奉慈禧太后密令，與好友孫中山進行了多次密談，動員孫中山回國效力。消息洩露後，反對中日同盟的榮祿，鼓動36名官員，上奏彈劾他“私會匪人”。但在慈禧太后的保護下，劉學詢沒有收到絲毫影響。慈禧太后親自下旨，命令他趕赴湖北，由湖廣總督張之洞“差遣委用”，協助張之洞制定當地與日本發展貿易的規劃。根據劉學詢日後回憶，慈禧太后明確告訴慶親王，這是對劉學詢的一種保護，讓他遠離京城的是非窩。但是，劉學詢還未成行，慈禧太后又下旨，將他調任廣東，由新任兩廣總督李鴻章“差遣委用”。

　　此時的北京，義和團運動風起雲湧，列強虎視眈眈，李鴻章的使命是要到廣州經營一片根據地，使“朝廷無南顧之憂”(直隸總督陳夔龍記載)，非常需要劉學詢這樣的對本地紅、白、黑各道都十分熟悉的人物。

　　李鴻章帶著劉學詢到任廣東，第一件大事就是重拳打黑(參閱本報2011年8月8日《廣東打黑1900》)，而財政上的改革，則是全面放開了廣東的賭博行業，除了早已公開經營“闈姓”賭博方式之外，山票、鋪票、番攤、彩票、“小闈姓”等賭徒們早已喜聞樂見的地下博彩，全部合法化，由政府發放執照，招標經營。劉學詢擔任大股東的“宏豐”公司，除了已經承包經營的“闈姓”之外，還承包了山票、鋪票的經營，進一步拓展了自己的業務空間，鞏固了賭王的地位。而在新成立的商務局中，劉學詢更被任命為局長，全面承擔為李鴻章財政創收的艱巨任務。


　　當八國聯軍終於入侵北京後，劉學詢配合孫中山及英國駐香港總督蔔力，出任“兩廣共和國總統”(參閱本報2010年4月19日《清失其鹿：庚子政治勢力大角逐》)。在他的穿針引線下，李鴻章同意與孫中山見面。劉學詢奉李鴻章之命，率兩艘軍艦到香港公海上迎接孫中山，但孫在最後一刻退縮，讓宮崎滔天和平山周等人代為出面，“首腦會談”降格成了“事務會談”，由劉學詢代表李鴻章談判。

　　李鴻章應中央要求北上時，在劉學詢陪同下專門在香港會見了港督，明確拒絕了兩廣獨立的建議。到達上海後，李鴻章就住進了劉學詢在上海的豪宅，長達兩個月，觀望風向。孫中山曾派人趕往上海，給劉學詢送信，請求劉資助其在惠州發動的武裝暴動，並許諾由劉學詢“主持內局，先立一暫時政府，以權理政務。政府之格式，先以五人足矣，主政一人，或稱總統，或稱帝王，弟決奉足下當之，故稱謂由足下裁決”。